تخلفات پژوهشی در سه مرحله پیش از پژوهش، در فرآیند پژوهش و پس از فرآیند پژوهش صورت می گیرد. عدم توجه به نیازسنجی پژوهش، خرید و فروش مقاله، دادهسازی، جعل و تحریف داده، کمکاری استاد در تحقیق دانشجویی، مشکلات داوری و... از مصادیق این کژکارکرد یها هستند.