سرپرست تیم معالج حضرت آیت الله مهدوی کنی، علت رحلت آیت الله مهدوی کنی را اختلال ریتم بطنی قلب اعلام و تاکید کرد: در واقع صبح روز سه شنبه و به دنبال عارضه قلبی و پس از حدود دو ساعت تلاش بی وقفه رییس بخش قلب بیمارستان مسیح دانشوری، رییس «آی سی یو» و متخصصین ریه بیمارستان شهید رجایی، ایشان در اوج اندوه همگان دار فانی را وداع گفت.